被人类用基因技术克隆出来的最强宠物小精灵超梦（市村正亲 配音）带着对自我身份的疑惑和对人类强大的愤怒逃离了科研所，它宣布要对制造出自己的人类进行复仇。 已经得到了八个勋章的小智（松本梨香 配音），以成为宠物小精灵训练大师为目标而不断的旅行，他带着皮卡丘（大谷育江 配音）和同伴小霞（饭冢雅弓 配音）小刚（上田佑司 配音）刚结束了和训练家的对战，接着收到了一封神秘人的邀请函，邀请他们参加世上最强的小精灵训练家的宴会。地点是新岛宠物小精灵城，这是最强训练家的邀请。他们很痛快的答应了，小智一行人穿过了狂风暴雨的海岸终于到达了新岛。一位叫乔伊的医生带领他们来到了宠物小精灵城，介绍最强的宠物小精灵训练家出场。没想到出现在大家面前的竟然是超梦。超梦的报复究竟是什么呢，一场大战即将开始......
演员：石田彰 丰口惠美 鸟海浩辅 田中理惠 绿川光 能登麻美子 坂本真绫 绪方惠美 神奈延年 小野坂昌也 泽城美雪 堀秀行 增谷康纪 山本兼平 岛田敏 折笠富美子 小松由佳 野岛健儿 三浦祥朗 私市淳 前田爱 种崎敦美 中岛唯 樱川惠 山崎惠理 高桥伸也 三宅麻理惠 福沙奈恵 田之中勇
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演员：岛本须美 二又一成 千叶繁 青木和代 三田友子 堀川亮 渊崎由里子 神谷明 鹤广美 庄真由美 榊原良子 大竹宏 矢田稔 若本规夫 古川登志夫 富山敬 京田尚子 富田耕生
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